Abstract
Colitis ulcerosa (UC) is een chronische inflammatoire darmziekte waarbij remissie mucosale genezing vereist: het onderdrukken van ontsteking en herstellen van de epitheliale barriŠrefunctie. Geavanceerde therapie‰n hebben het behandelaanbod verruimd, maar de therapiekeuze blijft grotendeels empirisch en er bestaan geen biomarkers om geneesmiddelkeuze of barriŠrerestauratie te sturen. Mucines zijn sleutelcomponenten van de intestinale slijmbarriŠre. Verstoorde mucine-expressie is gelinkt aan ziekteactiviteit en prognose, en mucinegenen vertonen uitgesproken RNA-isovormdiversiteit. Toch zijn therapieresponsieve mucine-isovormpatronen en hun relatie tot barriŠrefunctie nog niet op full-length resolutie beschreven. Dit project combineert single-nucleus long-read transcriptomics, multicentrische longitudinale mucine-isovormen, genomische mapping en pati‰nt-afgeleide organo‹den om mucine-isovormsignaturen te identificeren die samengaan met mucosale genezing. Met Nanopore-sequencing brengen we full-length mucinetranscripten in UC-biopten in kaart, koppelen we mucine dynamieken aan klinische, endoscopische en histologische respons, en onderzoeken we in organo‹den of normalisatie van afwijkende mucine RNA isovormen parallel loopt met barriŠreherstel. Door inzicht in mucinebiologie te verbinden met klinische data legt dit project de basis voor predictieve biomarkers en voor integratie van barriŠre-gecentreerde read-outs in geneesmiddelenontwikkeling en pati‰ntstratificatie bij UC.
Onderzoeker(s)
Onderzoeksgroep(en)
Financiering
Project type(s)